Jag har problem med att läsa av primaters släktträd. Trädet är baserat på proteinet myoglobin. Jag undrar således, överensstämmer släktträdet med den allmänna uppfattningen om släktskap mellan organismerna? Om inte – vilka kan vara orsakerna till avvikelserna? Hur är de tre primaterna – människa, gorilla och schimpans – placerade i förhållande till varandra. Människa Human, dödskalleapa SAISC, orangutang PONPY, babian PAPAN, schimpans PANTR, lemur LEPMU och gorilla GORBE.
Om man skulle konstruera ett fylogenetiskt träd baserat på många gener skulle man få ett artträd som kan skrivas som en kod i så kallat Newick-format:
(lemur,(dodskalleapa,(babian,(organutang,(gorilla,(schimpans,manniska))))));
Om man skriver in denna kod i en textfil (t ex i notepad) kan man öppna den i programmet FigTree (gratis för nerladdning http://tree.bio.ed.ac.uk/) och få trädet uppritat (programmet gillar inte å, ä och ö).
Att aminosyrasekvenserna för myoglobin genen inte ger någon upplösning (ett träd där många arter hamnar på samma gren – dvs är identiska) beror säkert på att den är utsatt för stark konserverande selektion (de flesta nya mutationer selekteras bort).
– Staffan Bensch
